Στις 28 Οκτωβρίου 2018, το MEGA Channel σταμάτησε να εκπέμπει μέσω της επίγειας ψηφιακής τηλεόρασης της Digea, εξαιτίας των σοβαρών οικονομικών προβλημάτων της Τηλέτυπος Α.Ε., της εταιρείας που διαχειριζόταν τότε τον σταθμό.
Το σήμα του καναλιού διακόπηκε τα ξημερώματα, την ώρα που προβαλλόταν ένα επεισόδιο της δημοφιλούς σειράς «Οι Απαράδεκτοι». Έτσι, έπειτα από σχεδόν 29 χρόνια παρουσίας, το MEGA έπαψε να μεταδίδεται ελεύθερα από την επίγεια ψηφιακή τηλεόραση. Το πρόγραμμά του, ωστόσο, παρέμεινε διαθέσιμο μέσω συνδρομητικών πλατφορμών, όπως η Nova και η COSMOTE TV, καθώς και μέσω διαδικτύου.
Η διακοπή της επίγειας μετάδοσης δεν σήμανε, τελικά, και το οριστικό τέλος του σταθμού. Το όνομα και το αρχείο του MEGA διατήρησαν την παρουσία τους, ενώ το ενδεχόμενο επιστροφής του στην ελεύθερη τηλεόραση έγινε πραγματικότητα περίπου ενάμιση χρόνο αργότερα.
Στις 17 Φεβρουαρίου 2020, το MEGA επέστρεψε στις τηλεοπτικές συχνότητες υπό τη νέα ιδιοκτησία του ομίλου Alter Ego Media. Με νέο πρόγραμμα, ενημερωτικές εκπομπές, δελτία ειδήσεων και αγαπημένες σειρές από το αρχείο του, ξεκίνησε ένα νέο κεφάλαιο στην πορεία του.
Από τη διακοπή του σήματος το 2018 μέχρι την επιστροφή του το 2020, το MEGA πέρασε μια δύσκολη περίοδο, καταφέρνοντας τελικά να επανέλθει στην ελληνική τηλεοπτική πραγματικότητα και να συνεχίσει την παρουσία του ως ένας από τους σημαντικούς σταθμούς της χώρας.
